Carlos Ortiz de Solórzano coordina una competición internacional que analiza 52 vídeos de microscopía para conocer cómo se comportan las células.
El Centro de Investigación Médica Aplicada (CIMA) de la Universidad de Navarra ha puesto en marcha un seguimiento automático de células para conocer las alteraciones implicadas en el cáncer.
"Estudiando el movimiento y proliferación de las células podemos conocer cómo funciona el organismo de los seres vivos, tanto en procesos normales como en alteraciones implicadas en enfermedades como el cáncer", sostiene Carlos Ortiz de Solórzano, director de la Plataforma de Imagen y del Laboratorio de Modelos Preclínicos y Herramientas de Análisis del CIMA.
El especialista coordina un "challenge" o competición internacional que analiza 52 vídeos de microscopía y en cuyo comité organizador participan investigadores de la Universidad Carlos III de Madrid junto con científicos de la República Checa, Paises Bajos y Alemania.
Los resultados, que se han publicado en el último número de la revista especializada Nature Methods, indican que muchas células de los seres vivos migran para cumplir sus funciones, tanto durante el desarrollo embrionario como en el individuo adulto, y lo hace en procesos normales y los anómalos como el cáncer, cuando salen del tumor primario para generar metástasis y colonizar otros tejidos.
"Estudiar cómo se mueven las células ayuda a conocer los procesos normales y patológicos", dice el experto de la CIMA en un comunicado, y añade que "el seguimiento o tracking celular es una herramienta muy útil también para conocer su genealogía, de dónde proceden las células de un órgano, de manera que se puedan estudiar los procesos iniciales de una enfermedad".
La competición presentada en Nature Methods recopila los resultados de las tres ediciones del "challenge", en las que han participado 21 grupos de 18 países sobre detección y seguimiento celular en vídeos de microscopía bi y tridimensional. En total, se han analizado 52 vídeos que ocupan 92 GB, algunos sintéticos, creados por un simulador de células, y el resto reales, de microscopía de campo claro, fluorescencia, bidireccional y tridimensional.
Para Carlos Ortiz de Solórzano, el trabajo realiza un análisis de los algoritmos utilizados para el tracking de los vídeos incluidos en la competición. Y las conclusiones de este análisis, afirma, "aportan información muy interesante para los desarrolladores de software, ya que tenemos unos datos muy variados, caracterizados y anotados".
Además el estudio proporciona información de interés también para potenciales usuarios de estos programas ya que los investigadores han "comprobado que funcionan mejor los algoritmos que utilizan técnicas de aprendizaje y aquellos que realizan el tracking en su conjunto, considerando toda la vida de las células, en lugar de realizar asociaciones temporales cercanas en el tiempo".
El challenge "sigue abierto online y el siguiente paso ahora es añadir nuevos datos, sobre todo los que tienen un análisis más complejo por su volumen, como son los vídeos que capturan el desarrollo embrionario de los seres vivos", ha comentado.
